廣東海洋大學深圳研究院（以下簡稱研究院）是由廣東海洋大學與深圳市大鵬新區管理委員會共建的深圳市屬事業單位，按照投資主體多元化，建設模式國際化，運行機制市場化，管理制度現代化要求，建設專業性、開放性、公益性、企業化運作、產學研緊密結合的新型研發平臺，建設具有獨立法人資格與事業單位性質的新型研發機構。
研究院實行理事會領導下的院長負責制，理事會為最高決策層，由科研單位、企業、政府和投資基金主體組成。同時，還將下設創新基金、創新平臺和孵化空間等多個與國際接軌的新型產業化平臺。
前期啟動項目總投資約1.55億元，其中最大部分的支出為高層次人才引進的6000萬，主要由廣東海洋大學聯合企業、投資基金出資，大鵬新區提供政策、場地、項目與資金等配套支持。
研究院作為深圳的第一家高等海洋教育科研機構，它的職責任務主要集科學研究、人才培養、成果轉化于一體，重點在海洋生物、海洋醫藥、海洋生態和濱海旅游等領域開展原始創新與集成創新，為深圳市經濟建設和社會發展服務。